More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1938 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1938  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
338 aa  692    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  89.09 
 
 
339 aa  587  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1883  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  88.79 
 
 
339 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2443  thiF protein, putative  68.65 
 
 
300 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1924  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60.88 
 
 
303 aa  351  8e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60.61 
 
 
303 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2024  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60.61 
 
 
309 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2437  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  61.4 
 
 
306 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164708  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2321  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60.27 
 
 
306 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.58316  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.47 
 
 
278 aa  275  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2590  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.18 
 
 
264 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2015  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  47.14 
 
 
292 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  47.12 
 
 
250 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2199  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.11 
 
 
268 aa  225  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2094  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.08 
 
 
282 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1772  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.62 
 
 
302 aa  215  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  43.37 
 
 
252 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  42.86 
 
 
252 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4405  adenylyltransferase ThiF  43.73 
 
 
252 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  41.94 
 
 
252 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  41.58 
 
 
252 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.07 
 
 
249 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.37 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.71 
 
 
252 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.71 
 
 
252 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.71 
 
 
252 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.71 
 
 
252 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.71 
 
 
252 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.71 
 
 
252 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.71 
 
 
252 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  36.92 
 
 
249 aa  192  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  37.67 
 
 
282 aa  192  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  38.13 
 
 
250 aa  192  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  41.94 
 
 
251 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.94 
 
 
251 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.21 
 
 
252 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.71 
 
 
249 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.86 
 
 
274 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  38.21 
 
 
252 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.65 
 
 
266 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  37.77 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.28 
 
 
271 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.71 
 
 
259 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.63 
 
 
250 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3855  adenylyltransferase ThiF  40.21 
 
 
265 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0345  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.21 
 
 
265 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.27 
 
 
252 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  38.57 
 
 
258 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.92 
 
 
250 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.92 
 
 
250 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0453  thiamine biosynthesis protein ThiF  40.21 
 
 
265 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000699536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.56 
 
 
250 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.97 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  37.28 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.69 
 
 
250 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5460  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  41.07 
 
 
251 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.04 
 
 
251 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.69 
 
 
250 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4002  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.5 
 
 
251 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03869  thiamine biosynthesis protein ThiF  40.5 
 
 
251 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4226  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.5 
 
 
251 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4033  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.5 
 
 
251 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948961 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4534  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.5 
 
 
251 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03822  hypothetical protein  40.5 
 
 
251 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.63 
 
 
246 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.71 
 
 
260 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.18 
 
 
251 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.81 
 
 
248 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.29 
 
 
259 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.886192  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.59 
 
 
250 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0205  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.65 
 
 
251 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.58 
 
 
259 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4440  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  40.14 
 
 
251 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.52 
 
 
266 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.77 
 
 
250 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.57 
 
 
259 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.84 
 
 
255 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.41 
 
 
259 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00364  adenylyltransferase  35.92 
 
 
257 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  35.48 
 
 
254 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  33.69 
 
 
253 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1811  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.59 
 
 
250 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.41 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0127  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.2 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  37.54 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3872  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.5 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.13 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.52 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.77 
 
 
252 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.98 
 
 
253 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  35.61 
 
 
257 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0043  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein  38.16 
 
 
257 aa  163  4.0000000000000004e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.562405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002074  sulfur carrier protein adenylyltransferase ThiF  35.89 
 
 
267 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.19 
 
 
252 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.41 
 
 
254 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0034  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.33 
 
 
249 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439342  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.68 
 
 
256 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.48 
 
 
256 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.95 
 
 
261 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.36 
 
 
480 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>