More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1945 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1945  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
350 aa  675    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410103  decreased coverage  0.00836902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2974  molydopterin biosynthesis protein  53.31 
 
 
346 aa  347  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0462  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  52.6 
 
 
358 aa  323  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.987597  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0909  UBA/THIF-type NAD/FAD binding  55.17 
 
 
350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.46 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.72 
 
 
348 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  56.8 
 
 
349 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.44 
 
 
266 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.23 
 
 
287 aa  249  7e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.23 
 
 
266 aa  246  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  48.59 
 
 
269 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  52.99 
 
 
253 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.714167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.79 
 
 
270 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  49.4 
 
 
264 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.6 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.19 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.98 
 
 
270 aa  238  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.61 
 
 
255 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.4 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.8 
 
 
249 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0617  molybdenum cofactor biosynthesis protein  52.76 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3943  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.39 
 
 
270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000910136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  49.4 
 
 
249 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.24 
 
 
272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49 
 
 
377 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.25 
 
 
387 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.39 
 
 
269 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.58 
 
 
278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0215  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  52.76 
 
 
266 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0006  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.58 
 
 
260 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.78 
 
 
260 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0364  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51.37 
 
 
266 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.31 
 
 
263 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.2 
 
 
259 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
264 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157622 
 
 
-
 
NC_004310  BR0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.39 
 
 
260 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.58 
 
 
383 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  47.89 
 
 
390 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4128  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.17 
 
 
270 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  0.228572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1632  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.45 
 
 
275 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  0.0862863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  48.79 
 
 
248 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.2 
 
 
280 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.39 
 
 
273 aa  226  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.42 
 
 
263 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.79 
 
 
392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0074  putative molybdopterin biosynthesis protein moeB  52.34 
 
 
267 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.02 
 
 
271 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1141  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.35 
 
 
266 aa  225  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.158288  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.8 
 
 
253 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.92 
 
 
255 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.61 
 
 
266 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0089  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.79 
 
 
266 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  48.62 
 
 
274 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.13 
 
 
390 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.18 
 
 
248 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1380  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.63 
 
 
271 aa  223  3e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1602  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.59 
 
 
277 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.8 
 
 
251 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.95 
 
 
256 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.59 
 
 
275 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.59 
 
 
267 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.90233  hitchhiker  0.0000000000838501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.22 
 
 
250 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.22 
 
 
250 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.22 
 
 
250 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.06 
 
 
250 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  46.43 
 
 
252 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0046  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  48.82 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.18 
 
 
379 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.58 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3157  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.55 
 
 
261 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  44.76 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4411  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.39 
 
 
274 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.18 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.85 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.74 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0654  thiF family protein  46.77 
 
 
248 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.61 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.58 
 
 
364 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.6 
 
 
259 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.77 
 
 
270 aa  219  6e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.24 
 
 
250 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  46.64 
 
 
396 aa  219  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.18 
 
 
399 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.8 
 
 
252 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.63 
 
 
386 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.8 
 
 
252 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  46.8 
 
 
252 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  46.8 
 
 
252 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  46.8 
 
 
252 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  46.8 
 
 
252 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  45.98 
 
 
393 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.85 
 
 
250 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  46.8 
 
 
252 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.01 
 
 
252 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.16 
 
 
375 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.61 
 
 
252 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.4 
 
 
256 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0038  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  50.86 
 
 
278 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  0.260889 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  48.24 
 
 
388 aa  216  4e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.99 
 
 
253 aa  216  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>