More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3288 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  100 
 
 
255 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  87.55 
 
 
255 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  81.67 
 
 
256 aa  431  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  78.49 
 
 
258 aa  427  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  78.09 
 
 
258 aa  424  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  61.51 
 
 
258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  55.73 
 
 
252 aa  275  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.01 
 
 
255 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.57 
 
 
244 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51.39 
 
 
254 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.43 
 
 
244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  0.000000738809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.04 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000178365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.02 
 
 
253 aa  230  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.06 
 
 
254 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0550  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.2 
 
 
254 aa  224  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.77 
 
 
242 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.43 
 
 
254 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  49.42 
 
 
255 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000182259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4484  hesA/moeB/thiF family protein  49.42 
 
 
255 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000692664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4296  hesA/moeB/thiF family protein  49.42 
 
 
255 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000113687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4134  hesA/moeB/thiF family protein  49.42 
 
 
255 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.456860000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4144  hesA/moeB/thiF family protein  49.42 
 
 
255 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4630  hesA/moeB/thiF family protein  49.42 
 
 
255 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000445557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4481  hesA/moeB/thiF family protein  49.42 
 
 
255 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6452e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4534  hesA/moeB/thiF family protein  49.42 
 
 
255 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3117  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.46 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000496284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0715  hesA/moeB/thiF family protein  48.64 
 
 
255 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000990791  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.8 
 
 
257 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4248  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.64 
 
 
255 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000534198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  46.43 
 
 
267 aa  205  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  49.21 
 
 
258 aa  202  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000394678  normal  0.987322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0064  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.28 
 
 
253 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0067  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.28 
 
 
253 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  46.15 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1191  HesA/MoeB/ThiF family protein  46.46 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.237248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.16 
 
 
242 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1719  hypothetical protein  44.88 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00168619  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1686  hypothetical protein  44.88 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000336589  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.83 
 
 
246 aa  189  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.49 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.58 
 
 
244 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0002961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0813  hypothetical protein  42.46 
 
 
236 aa  178  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000136128  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.62 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251146  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.68 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.02 
 
 
268 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  47.12 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  47.12 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  47.12 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  47.12 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  47.12 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  46.89 
 
 
341 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  47.12 
 
 
288 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  35.91 
 
 
269 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06440  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  41.5 
 
 
247 aa  168  9e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.217123 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  46.63 
 
 
288 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.19 
 
 
286 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0322  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.84 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.05 
 
 
269 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.96 
 
 
243 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.24 
 
 
273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.24 
 
 
242 aa  165  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  45.19 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.19 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2016  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.94 
 
 
248 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.19 
 
 
285 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2386  HesA/MoeB/ThiF family protein  40.94 
 
 
248 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.19 
 
 
285 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  43.94 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  43.94 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.4 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.02 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.19 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  35.61 
 
 
272 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  43.43 
 
 
268 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  43.43 
 
 
268 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  43.43 
 
 
268 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  43.43 
 
 
268 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  38.22 
 
 
276 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  43.43 
 
 
266 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  42.93 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.93 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.92 
 
 
240 aa  159  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.93 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  42.93 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  42.93 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  42.93 
 
 
268 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  44.5 
 
 
300 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  38.43 
 
 
302 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.43 
 
 
295 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.18 
 
 
237 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.2 
 
 
267 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.2 
 
 
267 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  42.42 
 
 
266 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.71 
 
 
285 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.94 
 
 
263 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4216  hypothetical protein  38.85 
 
 
270 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.11 
 
 
255 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.7 
 
 
272 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.23 
 
 
285 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>