More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1307 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
244 aa  501  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0002961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.06 
 
 
253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  58 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  55.14 
 
 
244 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  54.51 
 
 
258 aa  249  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000394678  normal  0.987322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0550  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.2 
 
 
254 aa  235  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0064  HesA/MoeB/ThiF family protein  47.18 
 
 
253 aa  225  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0067  HesA/MoeB/ThiF family protein  47.18 
 
 
253 aa  225  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.61 
 
 
244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  0.000000738809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.98 
 
 
255 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.3 
 
 
246 aa  208  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000178365  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06440  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  47.23 
 
 
247 aa  207  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.217123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  44.58 
 
 
255 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.95 
 
 
255 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.11 
 
 
242 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.86 
 
 
254 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.92 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.97 
 
 
258 aa  194  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.37 
 
 
258 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.21 
 
 
240 aa  192  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.78 
 
 
256 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  42.86 
 
 
249 aa  191  8e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.67 
 
 
258 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.59 
 
 
253 aa  188  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.81 
 
 
242 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.67 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.77 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  41.06 
 
 
252 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4484  hesA/moeB/thiF family protein  45.04 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000692664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3117  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.63 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000496284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4296  hesA/moeB/thiF family protein  45.04 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000113687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4134  hesA/moeB/thiF family protein  45.04 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.456860000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4144  hesA/moeB/thiF family protein  45.04 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.26 
 
 
254 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4481  hesA/moeB/thiF family protein  45.04 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6452e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4630  hesA/moeB/thiF family protein  45.04 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000445557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.41 
 
 
242 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.17 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4534  hesA/moeB/thiF family protein  45.04 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  45.04 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000182259  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0322  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.11 
 
 
240 aa  179  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0715  hesA/moeB/thiF family protein  44.63 
 
 
255 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000990791  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4248  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.63 
 
 
255 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000534198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.18 
 
 
254 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251146  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1686  hypothetical protein  43.44 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000336589  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1191  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.26 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.237248  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1719  hypothetical protein  43.44 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00168619  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.22 
 
 
252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.123515  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.91 
 
 
243 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.53 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0813  hypothetical protein  37.23 
 
 
236 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000136128  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4181  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.17 
 
 
259 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0515522 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.78 
 
 
261 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2016  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.17 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2386  HesA/MoeB/ThiF family protein  39.17 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  32.16 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  32.16 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  33.73 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.97 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  32.16 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  32.16 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  32.16 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  44.04 
 
 
272 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  42.11 
 
 
269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.44 
 
 
270 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  42.11 
 
 
269 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  31.76 
 
 
268 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.76 
 
 
268 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  31.76 
 
 
268 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.76 
 
 
268 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  31.76 
 
 
266 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  31.76 
 
 
268 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  32.95 
 
 
275 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  31.76 
 
 
268 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.91 
 
 
263 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.29 
 
 
214 aa  142  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.592704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.44 
 
 
272 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1574  peptide chain release factor 2  38.08 
 
 
216 aa  142  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.56 
 
 
275 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  32.56 
 
 
275 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.87 
 
 
275 aa  141  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.96 
 
 
268 aa  141  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.69 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  40.35 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.89 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  37.08 
 
 
276 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.85 
 
 
277 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  31.37 
 
 
266 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.35 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.96 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  38.86 
 
 
300 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  38.2 
 
 
255 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.25 
 
 
285 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.25 
 
 
285 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49350  hypothetical protein  41.01 
 
 
270 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0144415  normal  0.0686942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.21 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.62 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4216  hypothetical protein  41.57 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.63 
 
 
286 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1693  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.71 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>