50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5026 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 		 256 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.06 
 
 		 280 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.454327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1603  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.51 
 
 		 266 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6235  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  48.61 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.918479  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4405  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.15 
 
 		 265 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.18 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0920215  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6523  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.44 
 
 		 272 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87249 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4298  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.53 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.232236 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5595  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.67 
 
 		 275 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.47 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.886692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1657  hypothetical protein  43.65 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5068  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.53 
 
 		 285 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5191  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.96 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511652 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.93 
 
 		 269 aa  164  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2986  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.42 
 
 		 268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.33 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0540  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.69 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0069  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.72 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.701248  normal  0.470884 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0100  hypothetical protein  26.64 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0405921  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0065  ThiF family protein  26.64 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0042  ThiF family protein  26.64 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000190177 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0191  ThiF family protein  25.61 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.97 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.15 
 
 		 267 aa  52  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.15 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02000  NEDD8 activating enzyme, putative  28.05 
 
 		 428 aa  48.9  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0074  thiamine biosynthesis protein ThiF  24 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.95 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.64 
 
 		 379 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46734  predicted protein  28.96 
 
 		 438 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.06 
 
 		 407 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.12 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.36 
 
 		 241 aa  45.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3654  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.33 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.37 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.32 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.62 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2448  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.4 
 
 		 469 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.27 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.119618 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02327  Adenylyltransferase and sulfurtransferase uba4 (Ubiquitin-like protein activator 4)(Common component for nitrate reductase and xanthine dehydrogenase protein F) [Includes Adenylyltransferase uba4(EC 2.7.7.-);Sulfurtransferase uba4(EC 2.8.1.-)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59954]  29.69 
 
 		 560 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  0.681614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1369  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.77 
 
 		 458 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0006  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  24.11 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0075  thiamine biosynthesis protein ThiF  26.83 
 
 		 202 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  25.83 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.62 
 
 		 355 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  32.17 
 
 		 368 aa  42  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  32.17 
 
 		 368 aa  42  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.75 
 
 		 260 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>