33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0069 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0069  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 
285 aa  595  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.701248  normal  0.470884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0540  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.21 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.37 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4298  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.95 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.232236 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5068  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.68 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.54 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0920215  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4405  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.59 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1603  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.68 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189565  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.13 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.886692 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6235  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.86 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.918479  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5191  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.46 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.511652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1657  hypothetical protein  28.91 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.54 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75377  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0065  ThiF family protein  25.94 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94015  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0042  ThiF family protein  25.94 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000190177 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0191  ThiF family protein  25.09 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0100  hypothetical protein  25.94 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0405921  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6523  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.05 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.87249 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2986  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.19 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.7 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.454327 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5595  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.15 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.11 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4133  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 
464 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.6578  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.78 
 
 
213 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3654  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.93 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1659  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.57 
 
 
200 aa  45.8  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  26.83 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2548  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  31.46 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1399  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.59 
 
 
465 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61808  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00770  conserved hypothetical protein  25 
 
 
662 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660788  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1297  oligoendopeptidase F  28.44 
 
 
777 aa  43.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.907343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>