More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2463 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
347 aa  715    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2472  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.57 
 
 
367 aa  332  8e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.09 
 
 
348 aa  316  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  48.37 
 
 
345 aa  308  8e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  43.27 
 
 
377 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.69 
 
 
355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.44 
 
 
379 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  40.44 
 
 
390 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.79 
 
 
390 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.38 
 
 
386 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  44.38 
 
 
387 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.17 
 
 
390 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.36 
 
 
387 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  42.24 
 
 
368 aa  275  6e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  42.24 
 
 
368 aa  275  6e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.33 
 
 
383 aa  275  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.44 
 
 
375 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.56 
 
 
361 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  40.72 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  39.08 
 
 
390 aa  268  7e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.25 
 
 
395 aa  268  8e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  42.31 
 
 
388 aa  268  8.999999999999999e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.32 
 
 
266 aa  268  8.999999999999999e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.08 
 
 
392 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  40.56 
 
 
391 aa  267  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  41.11 
 
 
378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.5 
 
 
396 aa  266  5e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.71 
 
 
377 aa  266  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.58 
 
 
386 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.18 
 
 
383 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  38.48 
 
 
379 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.44 
 
 
393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.69 
 
 
387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1141  rhodanese-like  42.07 
 
 
381 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  40.91 
 
 
391 aa  259  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2905  hypothetical protein  41.34 
 
 
390 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3191  hypothetical protein  41.34 
 
 
390 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.755733 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.34 
 
 
383 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  40.62 
 
 
377 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20151  molybdopterin biosynthesis protein  40.96 
 
 
381 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28602  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.5 
 
 
398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.28 
 
 
386 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  38.4 
 
 
423 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.56 
 
 
266 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.7 
 
 
390 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.68 
 
 
390 aa  251  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.38 
 
 
390 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1456  hypothetical protein  40.12 
 
 
379 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.86 
 
 
236 aa  249  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  38.78 
 
 
393 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1527  hypothetical protein  38.68 
 
 
379 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.83 
 
 
399 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.02 
 
 
386 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.76 
 
 
392 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.61 
 
 
399 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165705  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22891  molybdopterin biosynthesis protein  38.63 
 
 
409 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.06 
 
 
393 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.06 
 
 
393 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  39.38 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.08 
 
 
395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.5 
 
 
400 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.5 
 
 
400 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.62 
 
 
396 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.66 
 
 
393 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  38.66 
 
 
393 aa  239  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
392 aa  238  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.22 
 
 
400 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1661  rhodanese-like protein  37.57 
 
 
380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17561  molybdopterin biosynthesis protein  37.33 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17601  molybdopterin biosynthesis protein  37.12 
 
 
381 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.27 
 
 
392 aa  233  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17761  molybdopterin biosynthesis protein  37.64 
 
 
381 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.65 
 
 
380 aa  232  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.59 
 
 
397 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.83 
 
 
480 aa  232  8.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48 
 
 
260 aa  232  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.58 
 
 
388 aa  231  1e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.12 
 
 
392 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_004310  BR0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.6 
 
 
260 aa  229  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.45 
 
 
278 aa  229  4e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.57 
 
 
389 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0006  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.56 
 
 
260 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762533  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.89 
 
 
390 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3943  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.12 
 
 
270 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000910136  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.94 
 
 
272 aa  226  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3396  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.53 
 
 
258 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270344  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.91 
 
 
403 aa  225  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  47.37 
 
 
248 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0364  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.49 
 
 
266 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.31 
 
 
393 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3793  molybdopterin biosynthesis protein  48.54 
 
 
271 aa  222  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.35 
 
 
268 aa  222  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1907  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.9 
 
 
364 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107566  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1231  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.86 
 
 
262 aa  220  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3157  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.69 
 
 
261 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1602  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.03 
 
 
277 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4411  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.9 
 
 
274 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1632  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.17 
 
 
275 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  0.0862863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08540  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  40.4 
 
 
403 aa  219  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.151924  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.46 
 
 
364 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>