More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6259 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  80.16 
 
 
249 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6207  IstB ATP binding domain-containing protein  78.78 
 
 
249 aa  410  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5782  IstB ATP binding domain-containing protein  78.78 
 
 
249 aa  410  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5629  IstB ATP binding domain-containing protein  78.78 
 
 
249 aa  410  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4731  IstB ATP binding domain-containing protein  78.78 
 
 
249 aa  410  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  78.6 
 
 
249 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  78.6 
 
 
249 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  60.66 
 
 
245 aa  319  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  60.5 
 
 
243 aa  311  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  60.5 
 
 
243 aa  311  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  60.5 
 
 
243 aa  311  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  59.58 
 
 
245 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  59.58 
 
 
245 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  59.58 
 
 
245 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  56.67 
 
 
251 aa  285  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  54.66 
 
 
251 aa  285  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  55.06 
 
 
251 aa  285  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4681  IstB ATP binding domain-containing protein  55.19 
 
 
256 aa  285  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  54.25 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  54.66 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  54.66 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0891  IstB ATP binding domain-containing protein  58.02 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  54.25 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  54.66 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  54.66 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  54.66 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  54.66 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1225  IstB ATP binding domain-containing protein  58.02 
 
 
251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0987  IstB ATP binding domain-containing protein  58.02 
 
 
251 aa  281  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1076  IstB ATP binding domain-containing protein  58.02 
 
 
251 aa  281  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1298  IstB ATP binding domain-containing protein  58.02 
 
 
251 aa  281  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2661  IstB ATP binding domain-containing protein  58.02 
 
 
251 aa  281  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3188  IstB ATP binding domain-containing protein  58.51 
 
 
243 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3709  IstB ATP binding domain-containing protein  58.51 
 
 
243 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  57.61 
 
 
251 aa  280  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1373  transposition helper protein  53.82 
 
 
252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0960565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0558  IstB ATP binding domain-containing protein  52.08 
 
 
246 aa  271  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5195  IstB-like ATP-binding protein  52.42 
 
 
262 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  50.62 
 
 
251 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7670  IstB ATP binding domain-containing protein  57.5 
 
 
252 aa  261  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7435  IstB ATP binding domain-containing protein  57.5 
 
 
252 aa  261  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277043  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3437  IstB ATP binding domain-containing protein  53.91 
 
 
259 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.370706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1039  IstB ATP binding domain-containing protein  51.54 
 
 
274 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3739  hypothetical protein  51.39 
 
 
256 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5412  IstB ATP binding domain-containing protein  53.5 
 
 
252 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.687138 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5453  IstB ATP binding domain-containing protein  52.92 
 
 
252 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4858  IstB ATP binding domain-containing protein  55.19 
 
 
252 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.323765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  49.79 
 
 
243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  49.38 
 
 
258 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  51.04 
 
 
251 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0135  IstB domain protein ATP-binding protein  44.77 
 
 
245 aa  235  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1364  IstB domain protein ATP-binding protein  44.77 
 
 
245 aa  235  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3594  IstB ATP binding domain-containing protein  47.72 
 
 
250 aa  235  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.687759  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  50.83 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  50.83 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3715  IstB domain protein ATP-binding protein  47.01 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0923789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  47.95 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4722  IstB ATP binding domain-containing protein  54.36 
 
 
252 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  49.58 
 
 
248 aa  229  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  49.58 
 
 
248 aa  229  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  49.58 
 
 
248 aa  229  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  47.52 
 
 
246 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3400  IstB ATP binding domain-containing protein  49.17 
 
 
248 aa  228  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0613  IstB ATP binding domain-containing protein  46.67 
 
 
254 aa  227  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.328728  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1216  IstB ATP binding domain-containing protein  62.65 
 
 
211 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814777  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  47.26 
 
 
246 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6464  IstB ATP binding domain-containing protein  48.75 
 
 
245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5655  IstB domain protein ATP-binding protein  45.31 
 
 
247 aa  221  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5849  IstB domain protein ATP-binding protein  46.41 
 
 
249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2962  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2153  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0849  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343949  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2119  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5320  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3091  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.664681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4233  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0581118  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4852  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.552048  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3693  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00207193  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3294  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6472  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6164  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6804  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6979  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5581  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2787  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.026191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3789  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0641169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4303  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 
247 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2547  IstB-like ATP-binding protein  47.37 
 
 
247 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.961939  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3547  hypothetical protein  50.49 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0707  IstB ATP binding domain-containing protein  43.33 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164792  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  45.08 
 
 
252 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  45.08 
 
 
252 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  45.08 
 
 
252 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0302  IstB ATP binding domain-containing protein  39.67 
 
 
252 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.355845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3123  IstB ATP binding domain-containing protein  39.67 
 
 
252 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.325822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2133  IstB ATP binding domain-containing protein  39.67 
 
 
252 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3015  IstB ATP binding domain-containing protein  39.67 
 
 
252 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2218  IstB domain protein ATP-binding protein  37.71 
 
 
258 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0507  IstB domain protein ATP-binding protein  37.29 
 
 
258 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.432003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>