More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4787 on replicon NC_008761
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  87.45 
 
 
245 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  72.69 
 
 
245 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  72.69 
 
 
245 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  72.69 
 
 
245 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  62.24 
 
 
249 aa  329  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  62.24 
 
 
249 aa  329  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  63.45 
 
 
249 aa  324  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6207  IstB ATP binding domain-containing protein  62.18 
 
 
249 aa  318  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4731  IstB ATP binding domain-containing protein  62.18 
 
 
249 aa  318  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5629  IstB ATP binding domain-containing protein  62.18 
 
 
249 aa  318  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5782  IstB ATP binding domain-containing protein  62.18 
 
 
249 aa  318  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  60.5 
 
 
251 aa  311  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4681  IstB ATP binding domain-containing protein  63.83 
 
 
256 aa  306  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1373  transposition helper protein  54.62 
 
 
252 aa  265  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0960565  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  54.2 
 
 
251 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  53.78 
 
 
251 aa  260  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  53.09 
 
 
251 aa  260  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  53.78 
 
 
251 aa  260  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  52.1 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  53.78 
 
 
251 aa  259  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3739  hypothetical protein  52.52 
 
 
256 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  52.94 
 
 
251 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  52.94 
 
 
251 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  52.94 
 
 
251 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  52.94 
 
 
251 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  52.94 
 
 
251 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  52.94 
 
 
251 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1216  IstB ATP binding domain-containing protein  74.84 
 
 
211 aa  249  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814777  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0558  IstB ATP binding domain-containing protein  47.06 
 
 
246 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0891  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
251 aa  237  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3709  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
243 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3188  IstB ATP binding domain-containing protein  49.16 
 
 
243 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  48.74 
 
 
251 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2661  IstB ATP binding domain-containing protein  48.74 
 
 
251 aa  234  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0987  IstB ATP binding domain-containing protein  48.74 
 
 
251 aa  234  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1076  IstB ATP binding domain-containing protein  48.74 
 
 
251 aa  234  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1225  IstB ATP binding domain-containing protein  48.74 
 
 
251 aa  234  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1298  IstB ATP binding domain-containing protein  48.74 
 
 
251 aa  234  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5195  IstB-like ATP-binding protein  47.52 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4858  IstB ATP binding domain-containing protein  48.74 
 
 
252 aa  232  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.323765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  48.54 
 
 
251 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5412  IstB ATP binding domain-containing protein  50 
 
 
252 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.687138 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7435  IstB ATP binding domain-containing protein  48.15 
 
 
252 aa  228  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277043  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7670  IstB ATP binding domain-containing protein  48.15 
 
 
252 aa  228  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3437  IstB ATP binding domain-containing protein  47.9 
 
 
259 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.370706 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5453  IstB ATP binding domain-containing protein  49.57 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  47.9 
 
 
243 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1039  IstB ATP binding domain-containing protein  45.83 
 
 
274 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0707  IstB ATP binding domain-containing protein  48.32 
 
 
258 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164792  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5849  IstB domain protein ATP-binding protein  47.26 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3715  IstB domain protein ATP-binding protein  43.28 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0923789 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  47.52 
 
 
258 aa  218  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  47.48 
 
 
247 aa  218  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  47.48 
 
 
247 aa  218  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4722  IstB ATP binding domain-containing protein  48.32 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  45.38 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  45.38 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  45.38 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3400  IstB ATP binding domain-containing protein  45.38 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0613  IstB ATP binding domain-containing protein  46.58 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.328728  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1364  IstB domain protein ATP-binding protein  41.6 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0135  IstB domain protein ATP-binding protein  41.6 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  44.96 
 
 
250 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  46.19 
 
 
246 aa  211  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  45.76 
 
 
246 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  42.26 
 
 
252 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  42.26 
 
 
252 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  42.26 
 
 
252 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6464  IstB ATP binding domain-containing protein  46.64 
 
 
245 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5655  IstB domain protein ATP-binding protein  44.96 
 
 
247 aa  204  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3547  hypothetical protein  46.83 
 
 
249 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3594  IstB ATP binding domain-containing protein  44.12 
 
 
250 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.687759  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2547  IstB-like ATP-binding protein  44.17 
 
 
247 aa  202  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.961939  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0038  IstB domain protein ATP-binding protein  42.55 
 
 
246 aa  195  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2119  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3693  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00207193  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6804  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2153  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2787  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.026191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3789  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0641169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3091  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.664681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2962  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4303  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4852  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.552048  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3294  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4233  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0581118  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0849  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343949  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5320  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6164  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5581  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6472  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6979  IstB domain protein ATP-binding protein  41.77 
 
 
247 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0778  IstB domain protein ATP-binding protein  40.59 
 
 
250 aa  189  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3434  IstB ATP binding domain-containing protein  44.12 
 
 
224 aa  185  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3015  IstB ATP binding domain-containing protein  38.2 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0302  IstB ATP binding domain-containing protein  38.2 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.355845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3123  IstB ATP binding domain-containing protein  38.2 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.325822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>