More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6464 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6464  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  71.25 
 
 		 248 aa  353  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  71.25 
 
 		 248 aa  353  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  71.25 
 
 		 248 aa  353  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  73.75 
 
 		 247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  73.75 
 
 		 247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3400  IstB ATP binding domain-containing protein  70.83 
 
 		 248 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5655  IstB domain protein ATP-binding protein  65.69 
 
 		 247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  64.17 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5412  IstB ATP binding domain-containing protein  61.48 
 
 		 252 aa  300  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.687138 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5453  IstB ATP binding domain-containing protein  60.41 
 
 		 252 aa  298  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3594  IstB ATP binding domain-containing protein  62.5 
 
 		 250 aa  298  6e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.687759  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  58.92 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1225  IstB ATP binding domain-containing protein  55 
 
 		 251 aa  274  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2661  IstB ATP binding domain-containing protein  55.42 
 
 		 251 aa  274  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0891  IstB ATP binding domain-containing protein  55.83 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0987  IstB ATP binding domain-containing protein  55 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1076  IstB ATP binding domain-containing protein  55 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1298  IstB ATP binding domain-containing protein  55 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3188  IstB ATP binding domain-containing protein  55.42 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3709  IstB ATP binding domain-containing protein  55.42 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  56.49 
 
 		 251 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  55.42 
 
 		 251 aa  271  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  56.67 
 
 		 258 aa  265  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0707  IstB ATP binding domain-containing protein  55.42 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164792  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3547  hypothetical protein  59.55 
 
 		 249 aa  258  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3715  IstB domain protein ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0923789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3739  hypothetical protein  52.92 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4858  IstB ATP binding domain-containing protein  52.92 
 
 		 252 aa  241  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.323765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1373  transposition helper protein  50.83 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0960565  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7435  IstB ATP binding domain-containing protein  53.11 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7670  IstB ATP binding domain-containing protein  53.11 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0613  IstB ATP binding domain-containing protein  51.04 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.328728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  47.97 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4731  IstB ATP binding domain-containing protein  49.79 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5782  IstB ATP binding domain-containing protein  49.79 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  47.97 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6207  IstB ATP binding domain-containing protein  49.79 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5629  IstB ATP binding domain-containing protein  49.79 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  49.38 
 
 		 249 aa  234  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  51.46 
 
 		 251 aa  234  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  51.05 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  51.46 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  51.46 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  51.46 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  51.46 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  51.46 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  51.46 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0558  IstB ATP binding domain-containing protein  46.72 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  50.2 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  50.63 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  50.63 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  48.75 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  48.95 
 
 		 245 aa  221  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  46.86 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4722  IstB ATP binding domain-containing protein  52.08 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3288  IstB ATP binding domain-containing protein  51.5 
 
 		 219 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1364  IstB domain protein ATP-binding protein  45.57 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0135  IstB domain protein ATP-binding protein  45.57 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  46.64 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  46.64 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  46.64 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  45.27 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5195  IstB-like ATP-binding protein  44.94 
 
 		 262 aa  204  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6164  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4233  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0581118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3294  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6979  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6472  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3789  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0641169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4852  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.552048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3693  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00207193  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2787  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.026191 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6804  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2119  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4303  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0849  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5320  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2962  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5581  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2153  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3091  IstB domain protein ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.664681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3437  IstB ATP binding domain-containing protein  44.35 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0038  IstB domain protein ATP-binding protein  42.26 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  47.34 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  47.34 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  47.34 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1039  IstB ATP binding domain-containing protein  43.67 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1831  ATPase  41.42 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00675411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1817  IstB domain protein ATP-binding protein  40.42 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.835381 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1428  IstB ATP binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1483  IstB ATP binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1926  IstB ATP binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2240  IstB ATP binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0053  IstB domain protein ATP-binding protein  41.8 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1545  IstB domain protein ATP-binding protein  41.8 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.138616  normal  0.0723168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>