More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1555 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3434  IstB ATP binding domain-containing protein  92.31 
 
 		 224 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  53.82 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  49.8 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  49.8 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  49.39 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  49.39 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  49.39 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  49.39 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  49.39 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  49.39 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  48.99 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  48.99 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  48.58 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  51.28 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  50.85 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0987  IstB ATP binding domain-containing protein  48.12 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1076  IstB ATP binding domain-containing protein  48.12 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1225  IstB ATP binding domain-containing protein  48.12 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1298  IstB ATP binding domain-containing protein  48.12 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2661  IstB ATP binding domain-containing protein  48.12 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3188  IstB ATP binding domain-containing protein  48.29 
 
 		 243 aa  228  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3709  IstB ATP binding domain-containing protein  48.29 
 
 		 243 aa  228  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3715  IstB domain protein ATP-binding protein  44.67 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0923789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0891  IstB ATP binding domain-containing protein  48.12 
 
 		 251 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  45.23 
 
 		 251 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01936  hypothetical protein  51.02 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06056  hypothetical protein  51.02 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  47.7 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00183  transposase  50.61 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06962  hypothetical protein  50.61 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  50.61 
 
 		 539 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  47.92 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  47.92 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  47.92 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  48.29 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0558  IstB ATP binding domain-containing protein  44.92 
 
 		 246 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1373  transposition helper protein  44.35 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0960565  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0135  IstB domain protein ATP-binding protein  45 
 
 		 245 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1364  IstB domain protein ATP-binding protein  45 
 
 		 245 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  43.03 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  45.73 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3594  IstB ATP binding domain-containing protein  43.93 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.687759  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  45.3 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  44.96 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  45.08 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  44.96 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5655  IstB domain protein ATP-binding protein  48.06 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5629  IstB ATP binding domain-containing protein  44.63 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4731  IstB ATP binding domain-containing protein  44.63 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5782  IstB ATP binding domain-containing protein  44.63 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6207  IstB ATP binding domain-containing protein  44.63 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 243 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 243 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 243 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3400  IstB ATP binding domain-containing protein  43.39 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  42.98 
 
 		 248 aa  204  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  42.98 
 
 		 248 aa  204  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  42.98 
 
 		 248 aa  204  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5412  IstB ATP binding domain-containing protein  41.42 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.687138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0613  IstB ATP binding domain-containing protein  44.12 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.328728  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5453  IstB ATP binding domain-containing protein  41 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6979  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5320  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4233  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0581118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3091  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.664681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2153  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5195  IstB-like ATP-binding protein  41.53 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2787  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.026191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3693  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00207193  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0849  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3294  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4852  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.552048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5581  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6164  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6472  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6804  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1039  IstB ATP binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4303  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2119  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2962  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3789  IstB domain protein ATP-binding protein  44.35 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0641169 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4858  IstB ATP binding domain-containing protein  40.96 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.323765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3739  hypothetical protein  39.42 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1595  IstB domain protein ATP-binding protein  42.32 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0526328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1549  IstB domain protein ATP-binding protein  42.32 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6464  IstB ATP binding domain-containing protein  47.34 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2133  IstB ATP binding domain-containing protein  40.25 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3123  IstB ATP binding domain-containing protein  40.25 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.325822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0302  IstB ATP binding domain-containing protein  40.25 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.355845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3015  IstB ATP binding domain-containing protein  40.25 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0038  IstB domain protein ATP-binding protein  41.91 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3437  IstB ATP binding domain-containing protein  41 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370706 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7670  IstB ATP binding domain-containing protein  43.6 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7435  IstB ATP binding domain-containing protein  43.6 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  41.2 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  41.2 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>