More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3437 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3437  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.370706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1039  IstB ATP binding domain-containing protein  71.76 
 
 
274 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5195  IstB-like ATP-binding protein  60.25 
 
 
262 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  53.23 
 
 
249 aa  263  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  53.23 
 
 
249 aa  263  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  53.5 
 
 
249 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  53.91 
 
 
251 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1373  transposition helper protein  52.61 
 
 
252 aa  257  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0960565  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5782  IstB ATP binding domain-containing protein  51.82 
 
 
249 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5629  IstB ATP binding domain-containing protein  51.82 
 
 
249 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4731  IstB ATP binding domain-containing protein  51.82 
 
 
249 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6207  IstB ATP binding domain-containing protein  51.82 
 
 
249 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  52.42 
 
 
251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  53.09 
 
 
251 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  53.09 
 
 
251 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  53.09 
 
 
251 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  53.09 
 
 
251 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  53.09 
 
 
251 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  53.09 
 
 
251 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  53.09 
 
 
251 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  53.09 
 
 
251 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  50.97 
 
 
251 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  53.09 
 
 
251 aa  248  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3739  hypothetical protein  50.41 
 
 
256 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  51.05 
 
 
245 aa  241  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0891  IstB ATP binding domain-containing protein  50.62 
 
 
251 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1225  IstB ATP binding domain-containing protein  48.61 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0987  IstB ATP binding domain-containing protein  49.79 
 
 
251 aa  232  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1076  IstB ATP binding domain-containing protein  49.79 
 
 
251 aa  232  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1298  IstB ATP binding domain-containing protein  49.79 
 
 
251 aa  232  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2661  IstB ATP binding domain-containing protein  49.79 
 
 
251 aa  232  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3188  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
243 aa  232  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3709  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
243 aa  232  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  47.28 
 
 
251 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7435  IstB ATP binding domain-containing protein  48.99 
 
 
252 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277043  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7670  IstB ATP binding domain-containing protein  48.99 
 
 
252 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  49.37 
 
 
245 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  49.37 
 
 
245 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  49.37 
 
 
245 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  47.9 
 
 
243 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  47.9 
 
 
243 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  47.9 
 
 
243 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  48.95 
 
 
251 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4858  IstB ATP binding domain-containing protein  47.28 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.323765 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  44.63 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0558  IstB ATP binding domain-containing protein  43.93 
 
 
246 aa  214  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4681  IstB ATP binding domain-containing protein  46.44 
 
 
256 aa  214  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4722  IstB ATP binding domain-containing protein  47.28 
 
 
252 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  45.53 
 
 
247 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  45.53 
 
 
247 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  42.39 
 
 
243 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  43.51 
 
 
248 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  43.51 
 
 
248 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  43.51 
 
 
248 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3400  IstB ATP binding domain-containing protein  43.51 
 
 
248 aa  201  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0613  IstB ATP binding domain-containing protein  43.85 
 
 
254 aa  201  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.328728  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  45.11 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0707  IstB ATP binding domain-containing protein  41.56 
 
 
258 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164792  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1364  IstB domain protein ATP-binding protein  42.86 
 
 
245 aa  198  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0135  IstB domain protein ATP-binding protein  42.86 
 
 
245 aa  198  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5412  IstB ATP binding domain-containing protein  42.86 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.687138 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5453  IstB ATP binding domain-containing protein  42.68 
 
 
252 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  44.17 
 
 
246 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6464  IstB ATP binding domain-containing protein  44.35 
 
 
245 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3715  IstB domain protein ATP-binding protein  37.45 
 
 
253 aa  188  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0923789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  41 
 
 
252 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  41 
 
 
252 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  41 
 
 
252 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5655  IstB domain protein ATP-binding protein  42.34 
 
 
247 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7623  IstB ATP binding domain-containing protein  59.52 
 
 
194 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.933232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  40.91 
 
 
250 aa  185  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3594  IstB ATP binding domain-containing protein  41.74 
 
 
250 aa  185  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.687759  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1831  ATPase  38.96 
 
 
246 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00675411  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2547  IstB-like ATP-binding protein  40 
 
 
247 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.961939  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0053  IstB domain protein ATP-binding protein  39.29 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1545  IstB domain protein ATP-binding protein  39.29 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.138616  normal  0.0723168 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3547  hypothetical protein  41.43 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1549  IstB domain protein ATP-binding protein  38.02 
 
 
250 aa  169  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1595  IstB domain protein ATP-binding protein  38.02 
 
 
250 aa  169  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0526328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1428  IstB ATP binding domain-containing protein  38.52 
 
 
248 aa  168  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1483  IstB ATP binding domain-containing protein  38.52 
 
 
248 aa  168  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1926  IstB ATP binding domain-containing protein  38.52 
 
 
248 aa  168  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2240  IstB ATP binding domain-containing protein  38.52 
 
 
248 aa  168  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1216  IstB ATP binding domain-containing protein  51.61 
 
 
211 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814777  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5849  IstB domain protein ATP-binding protein  39.32 
 
 
249 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0038  IstB domain protein ATP-binding protein  36.07 
 
 
246 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3123  IstB ATP binding domain-containing protein  34.32 
 
 
252 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.325822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2133  IstB ATP binding domain-containing protein  34.32 
 
 
252 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3015  IstB ATP binding domain-containing protein  34.32 
 
 
252 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0302  IstB ATP binding domain-containing protein  34.32 
 
 
252 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.355845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3091  IstB domain protein ATP-binding protein  38.28 
 
 
247 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.664681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2119  IstB domain protein ATP-binding protein  38.28 
 
 
247 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2962  IstB domain protein ATP-binding protein  38.28 
 
 
247 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2787  IstB domain protein ATP-binding protein  38.28 
 
 
247 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.026191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3693  IstB domain protein ATP-binding protein  38.28 
 
 
247 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00207193  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0849  IstB domain protein ATP-binding protein  38.28 
 
 
247 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343949  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3294  IstB domain protein ATP-binding protein  38.28 
 
 
247 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2153  IstB domain protein ATP-binding protein  38.28 
 
 
247 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3789  IstB domain protein ATP-binding protein  38.28 
 
 
247 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0641169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>