More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2786 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
250 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3594  IstB ATP binding domain-containing protein  77.87 
 
 
250 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.687759  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5655  IstB domain protein ATP-binding protein  73.06 
 
 
247 aa  377  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  66.53 
 
 
247 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  66.53 
 
 
247 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  63.22 
 
 
248 aa  315  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  63.22 
 
 
248 aa  315  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  63.22 
 
 
248 aa  315  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3400  IstB ATP binding domain-containing protein  62.81 
 
 
248 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6464  IstB ATP binding domain-containing protein  64.17 
 
 
245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  60.74 
 
 
243 aa  305  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  55.42 
 
 
251 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5453  IstB ATP binding domain-containing protein  57.74 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5412  IstB ATP binding domain-containing protein  57.74 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.687138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3188  IstB ATP binding domain-containing protein  54.32 
 
 
243 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3709  IstB ATP binding domain-containing protein  54.32 
 
 
243 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3547  hypothetical protein  61.64 
 
 
249 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0891  IstB ATP binding domain-containing protein  54.36 
 
 
251 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0987  IstB ATP binding domain-containing protein  54.36 
 
 
251 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1076  IstB ATP binding domain-containing protein  54.36 
 
 
251 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1225  IstB ATP binding domain-containing protein  54.36 
 
 
251 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1298  IstB ATP binding domain-containing protein  54.36 
 
 
251 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2661  IstB ATP binding domain-containing protein  53.94 
 
 
251 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  53.53 
 
 
251 aa  271  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3715  IstB domain protein ATP-binding protein  49.79 
 
 
253 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0923789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0707  IstB ATP binding domain-containing protein  49.4 
 
 
258 aa  252  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164792  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  51.04 
 
 
251 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1373  transposition helper protein  48.79 
 
 
252 aa  251  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0960565  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  51.04 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  51.04 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  51.04 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  51.04 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  51.04 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  51.04 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  51.05 
 
 
251 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  50.62 
 
 
251 aa  250  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
251 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
251 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  50.41 
 
 
258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3739  hypothetical protein  49.18 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  47.77 
 
 
249 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  47.77 
 
 
249 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  47.41 
 
 
249 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6207  IstB ATP binding domain-containing protein  47.54 
 
 
249 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5782  IstB ATP binding domain-containing protein  47.54 
 
 
249 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5629  IstB ATP binding domain-containing protein  47.54 
 
 
249 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4731  IstB ATP binding domain-containing protein  47.54 
 
 
249 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  47.95 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0613  IstB ATP binding domain-containing protein  47.13 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.328728  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7435  IstB ATP binding domain-containing protein  50.82 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277043  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7670  IstB ATP binding domain-containing protein  50.82 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  46.47 
 
 
251 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  47.13 
 
 
245 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1364  IstB domain protein ATP-binding protein  46.05 
 
 
245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0135  IstB domain protein ATP-binding protein  46.05 
 
 
245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0558  IstB ATP binding domain-containing protein  43.33 
 
 
246 aa  221  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  48.33 
 
 
245 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  48.33 
 
 
245 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  48.33 
 
 
245 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4858  IstB ATP binding domain-containing protein  47.95 
 
 
252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.323765 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  44.58 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  45.27 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  45.73 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  45.73 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  45.73 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  44.96 
 
 
243 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  44.96 
 
 
243 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  44.96 
 
 
243 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3288  IstB ATP binding domain-containing protein  51.49 
 
 
219 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4722  IstB ATP binding domain-containing protein  47.54 
 
 
252 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6979  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6472  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6164  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3789  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0641169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3693  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00207193  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3294  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3091  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.664681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5320  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6804  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2153  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2119  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4303  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4852  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.552048  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5581  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0849  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343949  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2787  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.026191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2962  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4233  IstB domain protein ATP-binding protein  44.53 
 
 
247 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0581118  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5195  IstB-like ATP-binding protein  43.57 
 
 
262 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1595  IstB domain protein ATP-binding protein  44.81 
 
 
250 aa  201  9e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0526328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1549  IstB domain protein ATP-binding protein  44.81 
 
 
250 aa  201  9e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1039  IstB ATP binding domain-containing protein  41.83 
 
 
274 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1831  ATPase  42.32 
 
 
246 aa  195  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00675411  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0038  IstB domain protein ATP-binding protein  41.15 
 
 
246 aa  194  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3434  IstB ATP binding domain-containing protein  46.31 
 
 
224 aa  194  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1428  IstB ATP binding domain-containing protein  42.32 
 
 
248 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1483  IstB ATP binding domain-containing protein  42.32 
 
 
248 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1926  IstB ATP binding domain-containing protein  42.32 
 
 
248 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2240  IstB ATP binding domain-containing protein  42.32 
 
 
248 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5849  IstB domain protein ATP-binding protein  39.66 
 
 
249 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>