More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1939 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
245 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  87.45 
 
 
243 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  87.45 
 
 
243 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  87.45 
 
 
243 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  72.38 
 
 
245 aa  362  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  72.38 
 
 
245 aa  362  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  72.38 
 
 
245 aa  362  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6207  IstB ATP binding domain-containing protein  62.45 
 
 
249 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  62.04 
 
 
249 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5629  IstB ATP binding domain-containing protein  62.45 
 
 
249 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5782  IstB ATP binding domain-containing protein  62.45 
 
 
249 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  62.04 
 
 
249 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4731  IstB ATP binding domain-containing protein  62.45 
 
 
249 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  63.9 
 
 
249 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4681  IstB ATP binding domain-containing protein  64.46 
 
 
256 aa  327  8e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  60.66 
 
 
251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1373  transposition helper protein  57.32 
 
 
252 aa  277  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0960565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  54.81 
 
 
251 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  55.23 
 
 
251 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  55.23 
 
 
251 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  55.23 
 
 
251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  54.81 
 
 
251 aa  268  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  54.81 
 
 
251 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  54.81 
 
 
251 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  54.81 
 
 
251 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  54.81 
 
 
251 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  54.81 
 
 
251 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  54.81 
 
 
251 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  54.81 
 
 
251 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3739  hypothetical protein  53.14 
 
 
256 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1216  IstB ATP binding domain-containing protein  75.48 
 
 
211 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814777  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3709  IstB ATP binding domain-containing protein  51.23 
 
 
243 aa  251  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3188  IstB ATP binding domain-containing protein  51.23 
 
 
243 aa  251  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0891  IstB ATP binding domain-containing protein  51.24 
 
 
251 aa  250  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1225  IstB ATP binding domain-containing protein  50.83 
 
 
251 aa  248  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  50.83 
 
 
251 aa  248  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0987  IstB ATP binding domain-containing protein  50.83 
 
 
251 aa  248  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.114335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1076  IstB ATP binding domain-containing protein  50.83 
 
 
251 aa  248  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1298  IstB ATP binding domain-containing protein  50.83 
 
 
251 aa  248  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2661  IstB ATP binding domain-containing protein  50.83 
 
 
251 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0558  IstB ATP binding domain-containing protein  48.54 
 
 
246 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5195  IstB-like ATP-binding protein  50.21 
 
 
262 aa  244  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3437  IstB ATP binding domain-containing protein  51.05 
 
 
259 aa  241  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.370706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4858  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.323765 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5412  IstB ATP binding domain-containing protein  50.21 
 
 
252 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.687138 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7670  IstB ATP binding domain-containing protein  50.63 
 
 
252 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  49.37 
 
 
251 aa  236  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7435  IstB ATP binding domain-containing protein  50.63 
 
 
252 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277043  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5453  IstB ATP binding domain-containing protein  49.79 
 
 
252 aa  235  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1039  IstB ATP binding domain-containing protein  48.16 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  48.76 
 
 
243 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  48.77 
 
 
247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  48.77 
 
 
247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0707  IstB ATP binding domain-containing protein  48.95 
 
 
258 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164792  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  48.95 
 
 
258 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2786  IstB-like ATP-binding protein  47.13 
 
 
250 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0613  IstB ATP binding domain-containing protein  48.12 
 
 
254 aa  226  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.328728  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3715  IstB domain protein ATP-binding protein  43.85 
 
 
253 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0923789 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  46.86 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  46.86 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  46.86 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3400  IstB ATP binding domain-containing protein  46.86 
 
 
248 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6464  IstB ATP binding domain-containing protein  48.95 
 
 
245 aa  221  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4722  IstB ATP binding domain-containing protein  48.95 
 
 
252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0135  IstB domain protein ATP-binding protein  42.8 
 
 
245 aa  218  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1364  IstB domain protein ATP-binding protein  42.8 
 
 
245 aa  218  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  46.38 
 
 
246 aa  215  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5849  IstB domain protein ATP-binding protein  45.57 
 
 
249 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  45.9 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  43.03 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  43.03 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  43.03 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3594  IstB ATP binding domain-containing protein  44.26 
 
 
250 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.687759  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5655  IstB domain protein ATP-binding protein  44.9 
 
 
247 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0038  IstB domain protein ATP-binding protein  43.51 
 
 
246 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2547  IstB-like ATP-binding protein  43.15 
 
 
247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.961939  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3547  hypothetical protein  47 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3091  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.664681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6472  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6804  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5581  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6164  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2962  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2787  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.026191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3294  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3693  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00207193  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3789  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0641169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2153  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  normal  0.27673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4233  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0581118  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2119  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4303  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0849  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343949  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5320  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4852  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.552048  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6979  IstB domain protein ATP-binding protein  41.32 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0778  IstB domain protein ATP-binding protein  41.25 
 
 
250 aa  192  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3434  IstB ATP binding domain-containing protein  44.98 
 
 
224 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1483  IstB ATP binding domain-containing protein  40.59 
 
 
248 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1926  IstB ATP binding domain-containing protein  40.59 
 
 
248 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2240  IstB ATP binding domain-containing protein  40.59 
 
 
248 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>