16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6220 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6220  DNA repair exonuclease-like protein  100 
 
 		 482 aa  981    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1635  DNA repair exonuclease-like protein  65.15 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5276  DNA repair exonuclease-like protein  65.15 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6788  DNA repair exonuclease-like protein  58.11 
 
 		 455 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2238  DNA repair exonuclease-like protein  54.09 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74733  normal  0.111488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2561  DNA repair exonuclease-like protein  52.17 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.215391 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4318  DNA repair exonuclease-like protein  43.79 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1567  metallophosphoesterase  49.17 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0723248  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3732  DNA repair exonuclease-like protein  42.55 
 
 		 448 aa  292  9e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  23.95 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  32.46 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  24.2 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  36.11 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  30.94 
 
 		 376 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  28.08 
 
 		 420 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  29.31 
 
 		 405 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>