26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1567 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1567  metallophosphoesterase  100 
 
 		 426 aa  851    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0723248  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2238  DNA repair exonuclease-like protein  73.25 
 
 		 436 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74733  normal  0.111488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2561  DNA repair exonuclease-like protein  71.39 
 
 		 445 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.215391 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5276  DNA repair exonuclease-like protein  49.2 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1635  DNA repair exonuclease-like protein  49.2 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6788  DNA repair exonuclease-like protein  50 
 
 		 455 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6220  DNA repair exonuclease-like protein  49.17 
 
 		 482 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4318  DNA repair exonuclease-like protein  46.84 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3732  DNA repair exonuclease-like protein  46.97 
 
 		 448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  26.91 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  28.24 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  23.33 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  28.53 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  24.75 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  23.65 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  24.8 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  24.94 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  27.2 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  27.53 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  24.26 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  27.25 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  25.6 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  24.67 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  25.48 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  25 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  24.51 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>