25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4318 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4318  DNA repair exonuclease-like protein  100 
 
 		 467 aa  969    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3732  DNA repair exonuclease-like protein  56.23 
 
 		 448 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2561  DNA repair exonuclease-like protein  46.8 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.215391 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6220  DNA repair exonuclease-like protein  43.56 
 
 		 482 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6788  DNA repair exonuclease-like protein  43.81 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2238  DNA repair exonuclease-like protein  45.07 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74733  normal  0.111488 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5276  DNA repair exonuclease-like protein  38.94 
 
 		 470 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1635  DNA repair exonuclease-like protein  38.94 
 
 		 470 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1567  metallophosphoesterase  46.3 
 
 		 426 aa  328  9e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0723248  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  26.26 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  27.33 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  25.61 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  25.69 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25.99 
 
 		 414 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  20.24 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  24.4 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  28.93 
 
 		 418 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  24.61 
 
 		 408 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  21.47 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  22.5 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  25.64 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  23.14 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  23.06 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  21.53 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  24.37 
 
 		 417 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>