20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3732 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3732  DNA repair exonuclease-like protein  100 
 
 		 448 aa  915    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4318  DNA repair exonuclease-like protein  56.23 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1567  metallophosphoesterase  46.38 
 
 		 426 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0723248  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2238  DNA repair exonuclease-like protein  45.22 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74733  normal  0.111488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2561  DNA repair exonuclease-like protein  43.66 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.215391 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6788  DNA repair exonuclease-like protein  44.94 
 
 		 455 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5276  DNA repair exonuclease-like protein  41.44 
 
 		 470 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1635  DNA repair exonuclease-like protein  41.44 
 
 		 470 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6220  DNA repair exonuclease-like protein  42.07 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  25.65 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  24.48 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  31.64 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  26.43 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  23.22 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  26.6 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  24.93 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  24.8 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  24.18 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  35.71 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  22.76 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>