28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6275 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  698    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  60 
 
 		 332 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  60 
 
 		 332 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  50.76 
 
 		 334 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  49.85 
 
 		 334 aa  341  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  34.27 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  33.96 
 
 		 354 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  33.96 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  31 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  32.54 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  30.11 
 
 		 369 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4960  hypothetical protein  32.26 
 
 		 394 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.763146 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  28.65 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  30.17 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  28.65 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  29.38 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  23.81 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  24.43 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4593  hypothetical protein  24.58 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.992954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4719  hypothetical protein  23.81 
 
 		 379 aa  53.1  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0117  hypothetical protein  26.44 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532023 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0234  plasmid segregation protein ParM  23.58 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2365  hypothetical protein  23.43 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000580643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0080  hypothetical protein  22.78 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.870943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  29.17 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0315  hypothetical protein  25.63 
 
 		 509 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2523  hypothetical protein  22.35 
 
 		 317 aa  42.7  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0013  plasmid segregation protein ParM  24.11 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>