15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0234 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0234  plasmid segregation protein ParM  100 
 
 		 319 aa  659    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0013  plasmid segregation protein ParM  47.32 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3447  StbA family protein  47.02 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.978374  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3561  StbA family protein  43.69 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0008  plasmid segregation protein ParM  42.72 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2664  plasmid segregation protein ParM  38.92 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301263 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0018  plasmid segregation protein ParM  40 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.419882  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0034  plasmid segregation protein ParM  38.87 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0737307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1926  plasmid segregation protein ParM  34.69 
 
 		 205 aa  129  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.272458  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4278  StbA family protein  23.22 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0106  plasmid stability protein StbA family protein  21.33 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  22.47 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  22.92 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  22.89 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  24.17 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>