42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2354 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  768    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  31.93 
 
 
384 aa  186  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  33.53 
 
 
342 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3280  hypothetical protein  27.98 
 
 
369 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000549349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2523  hypothetical protein  25.37 
 
 
317 aa  92.8  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0080  hypothetical protein  26.38 
 
 
393 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.870943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1191  hypothetical protein  24.4 
 
 
338 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0345  hypothetical protein  25.43 
 
 
348 aa  86.3  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  24.33 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0106  plasmid stability protein StbA family protein  27.27 
 
 
316 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0675  hypothetical protein  23.15 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.358837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0813  hypothetical protein  26.27 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  25.97 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2673  hypothetical protein  24.34 
 
 
325 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  25.71 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  24.89 
 
 
363 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3037  plasmid segregation protein ParM  27.27 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5321  hypothetical protein  25.61 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0589  hypothetical protein  23.21 
 
 
317 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  21.45 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1368  hypothetical protein  26.29 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  23.74 
 
 
332 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  23.74 
 
 
332 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3741  plasmid segregation protein ParM  23.76 
 
 
298 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  23.37 
 
 
347 aa  63.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  22.02 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  25.22 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0117  hypothetical protein  23.39 
 
 
337 aa  59.7  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000532023 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  26.56 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  22.25 
 
 
349 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  21.87 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  21.6 
 
 
334 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3948  hypothetical protein  25.91 
 
 
351 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  0.516752 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0315  hypothetical protein  20.45 
 
 
509 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4719  hypothetical protein  23.79 
 
 
379 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  25.74 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  22.29 
 
 
354 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0971  hypothetical protein  25.97 
 
 
316 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0234  plasmid segregation protein ParM  22.92 
 
 
319 aa  50.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  21.26 
 
 
348 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2365  hypothetical protein  22.89 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000580643  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4593  hypothetical protein  24.14 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.992954  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>