21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0106 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0106  plasmid stability protein StbA family protein  100 
 
 		 316 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  29.1 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4278  StbA family protein  28 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  27.27 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0013  plasmid segregation protein ParM  24.57 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  28.03 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3561  StbA family protein  28.97 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0234  plasmid segregation protein ParM  21.33 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0008  plasmid segregation protein ParM  24.63 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278379  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3447  StbA family protein  25.17 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.978374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2673  hypothetical protein  26.32 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1159  hypothetical protein  25.1 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0034  plasmid segregation protein ParM  23.4 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0737307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3741  plasmid segregation protein ParM  23.66 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2664  plasmid segregation protein ParM  22.18 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  20.91 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0018  plasmid segregation protein ParM  21.88 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.419882  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1191  hypothetical protein  20.26 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3037  plasmid segregation protein ParM  21.59 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3117  hypothetical protein  23.27 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0675  hypothetical protein  21.39 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.358837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>