16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0675 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0675  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.358837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  23.95 
 
 
376 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  27.38 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0813  hypothetical protein  27.58 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0117  hypothetical protein  24.13 
 
 
337 aa  59.3  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000532023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  23.77 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  24.78 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3741  plasmid segregation protein ParM  20.95 
 
 
298 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0345  hypothetical protein  23.58 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0106  plasmid stability protein StbA family protein  22.16 
 
 
316 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0971  hypothetical protein  22.93 
 
 
316 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  25.3 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  23.64 
 
 
332 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  23.64 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3948  hypothetical protein  20.16 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  0.516752 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  23.82 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>