28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5220 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  99.7 
 
 		 332 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  60 
 
 		 341 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  53.75 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  52.85 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  35.22 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  34.67 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  34.36 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  29.05 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  34.42 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  30.09 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  29.48 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  28.45 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4960  hypothetical protein  30.72 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.763146 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  26.69 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  28.36 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  23.74 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  24.64 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0345  hypothetical protein  26.14 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1191  hypothetical protein  24.15 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0813  hypothetical protein  25.89 
 
 		 324 aa  52.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0117  hypothetical protein  23.98 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532023 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0080  hypothetical protein  23.36 
 
 		 393 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.870943 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4593  hypothetical protein  24.58 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.992954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0315  hypothetical protein  24.76 
 
 		 509 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4719  hypothetical protein  23.73 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0675  hypothetical protein  23.64 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.358837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  25.14 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>