21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3667 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  711    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  42.94 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  29.48 
 
 
347 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  28.77 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  28.65 
 
 
354 aa  119  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  28.61 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  29.19 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  29.46 
 
 
334 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  28.45 
 
 
332 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  28.16 
 
 
332 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  29.46 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  27.01 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4960  hypothetical protein  26.69 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.763146 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  25.72 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  27 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  24.86 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2523  hypothetical protein  23.36 
 
 
317 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  24.37 
 
 
384 aa  57  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  22.25 
 
 
376 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1368  hypothetical protein  25.71 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3184  hypothetical protein  22.31 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>