24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6538 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  678    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  89.22 
 
 		 334 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  53.75 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  53.75 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  50.76 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  34.44 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  33.94 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  31.34 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  33.14 
 
 		 355 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 394 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.763146 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  30.03 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  27.48 
 
 		 355 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  28.77 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  29.28 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  27.33 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4593  hypothetical protein  25.72 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.992954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  21.53 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  23.3 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0080  hypothetical protein  22.7 
 
 		 393 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.870943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1191  hypothetical protein  23.58 
 
 		 338 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2523  hypothetical protein  23.82 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2365  hypothetical protein  24.47 
 
 		 383 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000580643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0813  hypothetical protein  29.96 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>