26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2530 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  732    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  68.1 
 
 
343 aa  472  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  64.62 
 
 
347 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  35.22 
 
 
332 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  35.22 
 
 
332 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  32.12 
 
 
350 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  33.84 
 
 
334 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  33.94 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  33.96 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  28.74 
 
 
355 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  28.92 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  30.72 
 
 
355 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  28.65 
 
 
349 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  28.1 
 
 
327 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  28.03 
 
 
348 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4960  hypothetical protein  28.49 
 
 
394 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.763146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0675  hypothetical protein  23.93 
 
 
329 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.358837  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  23.03 
 
 
313 aa  56.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0080  hypothetical protein  25.9 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.870943 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  22.32 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0117  hypothetical protein  23.55 
 
 
337 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000532023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0345  hypothetical protein  26 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3037  plasmid segregation protein ParM  25.55 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  25.32 
 
 
363 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0813  hypothetical protein  28.33 
 
 
324 aa  42.7  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2365  hypothetical protein  21.86 
 
 
383 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000580643  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>