27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2217 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  720    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  82.25 
 
 
343 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  64.62 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  34.94 
 
 
334 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  34.67 
 
 
332 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  34.67 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  34.44 
 
 
334 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  30.54 
 
 
350 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  34.27 
 
 
341 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  28.21 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  29.48 
 
 
349 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  29.82 
 
 
369 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  28.37 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4960  hypothetical protein  29.05 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.763146 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  28.74 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  27.93 
 
 
327 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  22.92 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4719  hypothetical protein  25.46 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3037  plasmid segregation protein ParM  25.33 
 
 
347 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2365  hypothetical protein  25.6 
 
 
383 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000580643  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  21.04 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0345  hypothetical protein  25.94 
 
 
348 aa  49.3  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1159  hypothetical protein  23.29 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4593  hypothetical protein  22.88 
 
 
364 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.992954  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3741  plasmid segregation protein ParM  23.24 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0315  hypothetical protein  21.7 
 
 
509 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  27.56 
 
 
363 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>