26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1600 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  705    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  82.25 
 
 		 347 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  68.1 
 
 		 354 aa  472  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  34.36 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  34.36 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  33.73 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  30.24 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  34.14 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  28.7 
 
 		 355 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  30.63 
 
 		 369 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  29.19 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4960  hypothetical protein  29.26 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.763146 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  28.49 
 
 		 348 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  27.14 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  29.17 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0117  hypothetical protein  24.48 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  21.87 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4719  hypothetical protein  26.89 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2365  hypothetical protein  25.41 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000580643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0675  hypothetical protein  25.99 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.358837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3741  plasmid segregation protein ParM  23.62 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3037  plasmid segregation protein ParM  26.2 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  20.68 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0345  hypothetical protein  25.56 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  25.69 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>