26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4769 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  721    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4960  hypothetical protein  37.04 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.763146 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  31.7 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  32.12 
 
 		 354 aa  162  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  30.54 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  30.24 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  31.34 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  30.29 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  29.05 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  28.75 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  30.95 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  30.43 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  30.93 
 
 		 341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  28.61 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  30.51 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  27.49 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  24.33 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  23.77 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  22.69 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0080  hypothetical protein  22.95 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.870943 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0813  hypothetical protein  25.36 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0117  hypothetical protein  21.81 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4593  hypothetical protein  20.85 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.992954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0675  hypothetical protein  24.52 
 
 		 329 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.358837  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3791  hypothetical protein  24.14 
 
 		 308 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>