19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1323 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0117  hypothetical protein  32.5 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  25.97 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  24.47 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0675  hypothetical protein  26.9 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.358837  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  23.91 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  25.37 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  23.03 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  23.3 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  21.83 
 
 		 342 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  26.35 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  22.69 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  21.04 
 
 		 347 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  22.01 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0234  plasmid segregation protein ParM  24.17 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  26.59 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0813  hypothetical protein  23.38 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  20.68 
 
 		 343 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1191  hypothetical protein  22.61 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>