26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0623 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  738    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0106  plasmid stability protein StbA family protein  29.1 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4278  StbA family protein  28.09 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  24.89 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0234  plasmid segregation protein ParM  22.47 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3447  StbA family protein  23.71 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.978374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  25.51 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3561  StbA family protein  29.33 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0008  plasmid segregation protein ParM  24.72 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278379  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0013  plasmid segregation protein ParM  25.39 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1159  hypothetical protein  25.83 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2523  hypothetical protein  23.3 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  24.08 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0034  plasmid segregation protein ParM  28.48 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0737307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  25.43 
 
 		 332 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2664  plasmid segregation protein ParM  24.48 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301263 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  29.17 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0345  hypothetical protein  24.9 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  26.91 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  24.36 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  25.32 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  25.14 
 
 		 332 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0018  plasmid segregation protein ParM  26.14 
 
 		 326 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.419882  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  26.59 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  27.56 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  25.69 
 
 		 343 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>