14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4278 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4278  StbA family protein  100 
 
 		 346 aa  712    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  28.09 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0106  plasmid stability protein StbA family protein  28 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0034  plasmid segregation protein ParM  23.28 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0737307 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3447  StbA family protein  28.12 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.978374  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0013  plasmid segregation protein ParM  24.62 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0234  plasmid segregation protein ParM  23.22 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3561  StbA family protein  28.5 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2664  plasmid segregation protein ParM  24.29 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301263 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0018  plasmid segregation protein ParM  23.62 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.419882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1159  hypothetical protein  24.7 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0008  plasmid segregation protein ParM  22.83 
 
 		 320 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278379  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1063  chaperone protein HscA  25.47 
 
 		 621 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  23.55 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>