23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4268 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  33.14 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  33.24 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  34.42 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  28.74 
 
 		 354 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  28.7 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  34.12 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  28.21 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  32.54 
 
 		 341 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  30.51 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  97.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  26.14 
 
 		 369 aa  97.1  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  29.55 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4960  hypothetical protein  29.48 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.763146 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  29.02 
 
 		 327 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  24.86 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  25.37 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  26.56 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  28.02 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0623  hypothetical protein  26.91 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2902  hypothetical protein  20.78 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0813  hypothetical protein  24.35 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2540  hypothetical protein  23.26 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000177139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>