17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0117 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0117  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  690    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000532023 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  32.5 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  23.68 
 
 
376 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  23.12 
 
 
355 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1191  hypothetical protein  24.85 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  23.98 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  23.98 
 
 
332 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  23.55 
 
 
354 aa  49.7  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0675  hypothetical protein  23.15 
 
 
329 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.358837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2523  hypothetical protein  27.74 
 
 
317 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  23.25 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  21.81 
 
 
350 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3741  plasmid segregation protein ParM  21.31 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  23.12 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0080  hypothetical protein  21.64 
 
 
393 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.870943 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  26.44 
 
 
341 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>