12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6255 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6255  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  324  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7361  TetR family transcriptional regulator-like protein  37.63 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1472  hypothetical protein  36.46 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.671208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3331  hypothetical protein  36.46 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7312  hypothetical protein  36.46 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7407  hypothetical protein  36.46 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7709  hypothetical protein  36.46 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319577  normal  0.0473635 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0269  hypothetical protein  36.46 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1215  TetR family transcriptional regulator-like protein  30.84 
 
 		 136 aa  45.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3161  hypothetical protein  42.47 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4251  hypothetical protein  36.27 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0802  hypothetical protein  35.46 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>