29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7361 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7361  TetR family transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4323  hypothetical protein  40.19 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3441  TetR family transcriptional regulator-like protein  35.43 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3480  TetR family transcriptional regulator-like protein  35.43 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5713  TetR family transcriptional regulator-like protein  33.87 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6255  hypothetical protein  37.63 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1215  TetR family transcriptional regulator-like protein  38.82 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6752  TetR family transcriptional regulator-like protein  32.03 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6275  hypothetical protein  32.26 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  36.92 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  36.92 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  36.92 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  36.92 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  36.92 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  36.92 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  36.92 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  35.38 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  37.1 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  35.38 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5933  Tn554-related, transposase C  31.34 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3902  Tn554-related, transposase C  31.34 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4263  hypothetical protein  29.36 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3898  Tn554-related, transposase C  31.34 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4401  hypothetical protein  29.36 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0480  Tn554-related, transposase C  31.34 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0694  Tn554-related, transposase C  30.6 
 
 		 147 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  33.85 
 
 		 197 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  36.07 
 
 		 197 aa  40.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  38.46 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>