225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6194 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0079  hypothetical protein  62 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0062  hypothetical protein  62 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4601  hypothetical protein  57.57 
 
 		 335 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.16736 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4252  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.88 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1698  hypothetical protein  44.19 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.555013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2034  hypothetical protein  44.19 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.571695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1535  putative surface antigen protein  38.82 
 
 		 347 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3441  hypothetical protein  38.3 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.597257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6377  hypothetical protein  27.76 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.498537  normal  0.74546 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6734  hypothetical protein  28.22 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.745861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  26.75 
 
 		 1094 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0312  hypothetical protein  25.44 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.15 
 
 		 752 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1667 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  27.57 
 
 		 335 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.74 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  26.81 
 
 		 819 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.69 
 
 		 689 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  26.41 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.17 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.92 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.22 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1167  hypothetical protein  22.03 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7989  NHL repeat containing protein  21.41 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  26.4 
 
 		 391 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  26.97 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.64 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6158  hypothetical protein  25.09 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.12 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.56 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.72 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.72 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.79 
 
 		 974 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  33.61 
 
 		 810 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.35 
 
 		 601 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.73 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.11 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.48 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.03 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.69 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  27.27 
 
 		 971 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  24.9 
 
 		 556 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  25.99 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.74 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.15 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.86 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.58 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.9 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.88 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  23.29 
 
 		 776 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.68 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.23 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.37 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2432  hypothetical protein  24.09 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.750639  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.46 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3159  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.19 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0895  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.71 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.01 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.12 
 
 		 829 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  22.01 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.87 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.52 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.73 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1869  hypothetical protein  20.72 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.48 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.58 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  23.33 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  27.54 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  23.78 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.7 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.03 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.03 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.59 
 
 		 660 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.27 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.27 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.53 
 
 		 154 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7977  hypothetical protein  24.2 
 
 		 497 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37687  normal  0.148037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.58 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.14 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.43 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.03 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.27 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  26.99 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.87 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.27 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.85 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.46 
 
 		 943 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  28.26 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.47 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.4 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.59 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.77 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2457  cytochrome d1 heme region  22.07 
 
 		 660 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2513  hypothetical protein  20 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  21.82 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.97 
 
 		 478 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581027  normal  0.0149347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>