238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0079 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0079  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  685    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0062  hypothetical protein  98.55 
 
 
345 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4601  hypothetical protein  62.97 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.16736 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  60.38 
 
 
348 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1698  hypothetical protein  47.65 
 
 
358 aa  315  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.555013  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2034  hypothetical protein  47.65 
 
 
358 aa  315  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.571695  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4252  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.57 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1535  putative surface antigen protein  39.46 
 
 
347 aa  241  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3441  hypothetical protein  37.62 
 
 
331 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.597257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.51 
 
 
752 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  26.29 
 
 
1094 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6377  hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.498537  normal  0.74546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  26.29 
 
 
335 aa  95.9  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0312  hypothetical protein  25.96 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.61 
 
 
354 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  24.36 
 
 
1667 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2432  hypothetical protein  28.35 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.750639  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.32 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.71 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.11 
 
 
689 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.88 
 
 
272 aa  77  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6734  hypothetical protein  22.87 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.745861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  27.34 
 
 
819 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.57 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.71 
 
 
353 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  26.32 
 
 
810 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.31 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1167  hypothetical protein  22.7 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.64 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  23.35 
 
 
391 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.92 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.31 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.6 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  23.35 
 
 
580 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.69 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.18 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.04 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.32 
 
 
329 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  26.7 
 
 
330 aa  67  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.91 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.71 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.75 
 
 
517 aa  66.2  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6158  hypothetical protein  22.3 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2626  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.62 
 
 
659 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  24.42 
 
 
556 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  22.18 
 
 
776 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.14 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.12 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.69 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  20.5 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.68 
 
 
601 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.83 
 
 
154 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.85 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.44 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.86 
 
 
383 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0586  putative receptor  26.49 
 
 
358 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.29 
 
 
326 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1165  hypothetical protein  22.64 
 
 
325 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.91 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  24.12 
 
 
250 aa  63.2  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  30.15 
 
 
408 aa  62.8  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.23 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.23 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  21.89 
 
 
971 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.23 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.12 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.66 
 
 
974 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.69 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  25.39 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  21.46 
 
 
479 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.64 
 
 
348 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2513  hypothetical protein  25.69 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  26.71 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.11 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7989  NHL repeat containing protein  20.88 
 
 
335 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575818  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.25 
 
 
318 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  26.18 
 
 
1189 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.24 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.43 
 
 
299 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7052  hypothetical protein  29.19 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0830249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.24 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.24 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.73 
 
 
410 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.16 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.82 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.43 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  25.15 
 
 
457 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.58 
 
 
365 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  24.68 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7977  hypothetical protein  25.77 
 
 
497 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37687  normal  0.148037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  25.47 
 
 
324 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  28.24 
 
 
387 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1253  hypothetical protein  27.61 
 
 
679 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.337339  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  25.47 
 
 
324 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.12 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.05 
 
 
821 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.78 
 
 
660 aa  56.2  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.74 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  23.62 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.14 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>