151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2432 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2432  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  672    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.750639  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  25.56 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1698  hypothetical protein  26.01 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.555013  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2034  hypothetical protein  26.01 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.571695  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0079  hypothetical protein  28.52 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.71 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0062  hypothetical protein  28.52 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  25.97 
 
 
1094 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.91 
 
 
752 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  29.27 
 
 
580 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  27.81 
 
 
391 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  27.93 
 
 
1667 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4601  hypothetical protein  27.78 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.16736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.59 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  27.23 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.36 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.43 
 
 
689 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.79 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.55 
 
 
457 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6734  hypothetical protein  25.26 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.745861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.51 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.54 
 
 
479 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0312  hypothetical protein  23.18 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.59 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.78 
 
 
354 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  22.81 
 
 
810 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  27.12 
 
 
971 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  24.09 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.92 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  28 
 
 
387 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6158  hypothetical protein  26.76 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.12 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.04 
 
 
335 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.5 
 
 
336 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7989  NHL repeat containing protein  25.56 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  22.92 
 
 
819 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.93 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  22.14 
 
 
325 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.56 
 
 
652 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3441  hypothetical protein  22.08 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.597257 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.87 
 
 
323 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.2 
 
 
332 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.81 
 
 
312 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  28.22 
 
 
479 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.85 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.4 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6377  hypothetical protein  20.48 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.498537  normal  0.74546 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.02 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.57 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.37 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.86 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.28 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.87 
 
 
974 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.18 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.56 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.47 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.36 
 
 
362 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  25.74 
 
 
546 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3171  hypothetical protein  27.51 
 
 
482 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  24.05 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.36 
 
 
821 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.38 
 
 
272 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.3 
 
 
601 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4699  hypothetical protein  28.63 
 
 
363 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.23 
 
 
320 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.14 
 
 
330 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.71 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.85 
 
 
324 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.5 
 
 
362 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.81 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.4 
 
 
575 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.03 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.94 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.81 
 
 
366 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.7 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.16 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  26.5 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  25.29 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2457  cytochrome d1 heme region  21.71 
 
 
660 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.22 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  23.4 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.77 
 
 
366 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.5 
 
 
345 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3073  hypothetical protein  26.77 
 
 
473 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.31 
 
 
328 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1869  hypothetical protein  24.23 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.31 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.35 
 
 
192 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.69 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.81 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1257  hypothetical protein  31.71 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.44 
 
 
1067 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.72 
 
 
660 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  24.66 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.23 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  26.32 
 
 
640 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.67 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.84 
 
 
366 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>