190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6734 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6734  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  688    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.745861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6377  hypothetical protein  42.28 
 
 
340 aa  258  9e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.498537  normal  0.74546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0312  hypothetical protein  42.59 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3441  hypothetical protein  26.1 
 
 
331 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.597257 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  28.22 
 
 
348 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4252  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.91 
 
 
344 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2034  hypothetical protein  23.25 
 
 
358 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.571695  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1698  hypothetical protein  23.25 
 
 
358 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.555013  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7989  NHL repeat containing protein  25.34 
 
 
335 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575818  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1167  hypothetical protein  24.29 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1535  putative surface antigen protein  25.76 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1869  hypothetical protein  24.3 
 
 
354 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.71 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4601  hypothetical protein  24.73 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.16736 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0079  hypothetical protein  22.87 
 
 
345 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0062  hypothetical protein  23.08 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.31 
 
 
752 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6158  hypothetical protein  24.65 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  22.97 
 
 
1667 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.96 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  25.5 
 
 
479 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.88 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1940  hypothetical protein  28.15 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  21.79 
 
 
810 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.66 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.59 
 
 
353 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2432  hypothetical protein  25.26 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.750639  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.95 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  25.76 
 
 
1094 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.98 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.45 
 
 
326 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.5 
 
 
347 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.56 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.06 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.95 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.59 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.36 
 
 
314 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.91 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  25 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  24.4 
 
 
580 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.44 
 
 
348 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.71 
 
 
328 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.09 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.41 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.53 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.29 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.74 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.24 
 
 
689 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.67 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  26.09 
 
 
391 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.19 
 
 
312 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.88 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.77 
 
 
415 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.31 
 
 
1067 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.88 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  30.08 
 
 
457 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.1 
 
 
334 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  26.47 
 
 
250 aa  57  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.84 
 
 
325 aa  57  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.24 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  26.5 
 
 
971 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.59 
 
 
317 aa  56.2  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  29.27 
 
 
314 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.88 
 
 
328 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.75 
 
 
324 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.54 
 
 
362 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.8 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.88 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.46 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.31 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.12 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.2 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.84 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  24.49 
 
 
408 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2448  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.84 
 
 
658 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165811  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  22.22 
 
 
776 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.37 
 
 
362 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.14 
 
 
332 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.18 
 
 
457 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1302  hypothetical protein  28.1 
 
 
364 aa  53.1  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.127226  normal  0.259109 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.64 
 
 
365 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.07 
 
 
377 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.23 
 
 
327 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  24.88 
 
 
819 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  28.97 
 
 
312 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.45 
 
 
329 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2457  cytochrome d1 heme region  21.05 
 
 
660 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  26.18 
 
 
330 aa  52.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0484  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.52 
 
 
323 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558778 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.76 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.52 
 
 
340 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  23.01 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.85 
 
 
345 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.11 
 
 
348 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1118  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.42 
 
 
467 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.52 
 
 
340 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.52 
 
 
340 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0625  hypothetical protein  24.64 
 
 
376 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.75 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  25.39 
 
 
335 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>