56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6233 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6233  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 157 aa  306  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0997303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5253  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  57.14 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438086  normal  0.967685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1612  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  57.14 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6520  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  40.76 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5596  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  41.96 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  32.89 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2627  17 kDa surface antigen  34.21 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.940371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3037  17 kDa surface antigen  34.21 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  33.55 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  33.55 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  33.55 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000817006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  33.33 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  33.33 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  33.33 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  33.33 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  33.33 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  32.68 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  32.68 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  32.68 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  32.68 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  32.68 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  32.68 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  32.68 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  32.68 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  32.68 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  28.76 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1807  17 kDa surface antigen  32.89 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55882  hitchhiker  0.000926812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  28.29 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2665  17 kDa surface antigen  32.89 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  35.67 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  34.42 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3432  17 kDa surface antigen  35.67 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0130273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2381  17 kDa surface antigen  32.89 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00375113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  33.76 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1723  17 kDa surface antigen  31.58 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00134301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  35.53 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1219  outer membrane lipoprotein PcP  28.76 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0378  outer membrane lipoprotein PcP  28.76 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0525  17 kDa surface antigen  32.47 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  31.51 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  32.47 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0501  17 kDa surface antigen  32.47 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.354763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  32.47 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  32.47 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  0.000059328 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0445  17 kDa surface antigen  28.1 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1690  17 kDa surface antigen  31.58 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  26.04 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  27.81 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  23.57 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2250  17 kDa surface antigen  27.33 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454882  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2606  15 kDa peptidoglycan-associated lipoprotein  28.57 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2888  15 kDa peptidoglycan-associated lipoprotein  28.57 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0208  surface antigen protein  42.22 
 
 		 152 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  25.49 
 
 		 160 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  26.28 
 
 		 158 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4999  hypothetical protein  29.55 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>