96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2052 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  314  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  62.82 
 
 
156 aa  201  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  61.54 
 
 
156 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  62.18 
 
 
156 aa  201  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  60.9 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  62.03 
 
 
158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  62.89 
 
 
160 aa  194  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2581  17 kDa surface antigen  62.82 
 
 
156 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000185697  normal  0.0842318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  62.59 
 
 
147 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2461  17 kDa surface antigen  62.82 
 
 
156 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000826442  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1883  17 kDa surface antigen  62.18 
 
 
156 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119533  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2223  17 kDa surface antigen  61.54 
 
 
156 aa  184  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000654513  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  64.66 
 
 
164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2250  17 kDa surface antigen  66.89 
 
 
164 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  57.59 
 
 
158 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1570  17 kDa surface antigen  66.67 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000417711  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0595  hypothetical protein  54.74 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003952  outer membrane lipoprotein  48.57 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0034992  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01571  hypothetical protein  44.22 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  35.61 
 
 
179 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  35.38 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  35.38 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  38.94 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  35.38 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  35.38 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  35.38 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  34.85 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  34.85 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  34.85 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  34.85 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  34.85 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  34.85 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  34.85 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  34.85 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  45.33 
 
 
178 aa  57.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  34.69 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  31.3 
 
 
155 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  31.3 
 
 
155 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  31.3 
 
 
155 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  31.3 
 
 
155 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  31.3 
 
 
155 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1807  17 kDa surface antigen  31.47 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55882  hitchhiker  0.000926812 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  33.83 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  33.83 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  33.83 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000817006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  58.14 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  30.53 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  30.53 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  30.53 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  30.53 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  30.53 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  30.53 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  30.53 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  30.53 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  30.53 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  33.58 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  44 
 
 
179 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6233  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  27.81 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0997303  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  46.88 
 
 
206 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  62.16 
 
 
215 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  62.16 
 
 
215 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  62.16 
 
 
216 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  40.7 
 
 
218 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  40.7 
 
 
218 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  40.7 
 
 
218 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  40.7 
 
 
218 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  40.7 
 
 
218 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  45.31 
 
 
204 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  34.57 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  62.16 
 
 
216 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  40.7 
 
 
218 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  40.7 
 
 
218 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  38.75 
 
 
208 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  62.16 
 
 
272 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  36.14 
 
 
257 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  36.14 
 
 
257 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  51.79 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  30.43 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  59.46 
 
 
217 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  28.17 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  30 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  26.72 
 
 
951 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  36.67 
 
 
179 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  36.67 
 
 
179 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2665  17 kDa surface antigen  34.59 
 
 
155 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2381  17 kDa surface antigen  34.59 
 
 
155 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00375113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  39.44 
 
 
182 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  32.82 
 
 
155 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  36.67 
 
 
179 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  31.48 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  44.68 
 
 
180 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4999  hypothetical protein  31.46 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  44.68 
 
 
176 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4325  hypothetical protein  29.19 
 
 
154 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138091  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  36.67 
 
 
179 aa  40.4  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>