41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4999 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4999  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  330  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19520  outer membrane lipoprotein  37.59 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3852  lipoprotein SlyB, putative  39.13 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  42.03 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1167  17 kDa surface antigen  42.03 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4115  lipoprotein SlyB, putative  40.68 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.404382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50740  hypothetical protein  38.89 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4284  17 kDa surface antigen  40.58 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4325  hypothetical protein  38.89 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1231  surface antigen protein  40.58 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1131  17 kDa surface antigen  40.58 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  30.91 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  30.91 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  30.91 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  30.91 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  30.91 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  30.3 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  30.3 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  30.3 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  30.3 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  30.3 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  30.3 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  30.3 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  30.3 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  30.3 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  22.99 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1807  17 kDa surface antigen  28.49 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55882  hitchhiker  0.000926812 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  35.16 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  35.16 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2381  17 kDa surface antigen  37.86 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00375113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  32.97 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  35.16 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  35.16 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1440  17 kDa surface antigen  44.9 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.58 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2665  17 kDa surface antigen  37.86 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003797  putative outer membrane lipoprotein Pcp  48.84 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2581  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 		 156 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000185697  normal  0.0842318 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6233  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  29.55 
 
 		 157 aa  40.8  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0997303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2461  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 		 156 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000826442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>