131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1440 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1440  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 153 aa  293  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  77.92 
 
 		 154 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4325  hypothetical protein  77.92 
 
 		 154 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50740  hypothetical protein  77.27 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3852  lipoprotein SlyB, putative  79.87 
 
 		 154 aa  203  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19520  outer membrane lipoprotein  79.87 
 
 		 154 aa  203  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1167  17 kDa surface antigen  77.92 
 
 		 154 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1131  17 kDa surface antigen  76.62 
 
 		 154 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4284  17 kDa surface antigen  76.62 
 
 		 154 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1231  surface antigen protein  76.62 
 
 		 154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4115  lipoprotein SlyB, putative  79.22 
 
 		 154 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.404382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  58.82 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  54.3 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  44 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  44.03 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  43.87 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  43.87 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  43.87 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  0.000059328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3432  17 kDa surface antigen  42.14 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0130273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  43.87 
 
 		 157 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0501  17 kDa surface antigen  43.87 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.354763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0525  17 kDa surface antigen  43.87 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  44.76 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  40.94 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2507  outer membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3507  outer membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1157  outer membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0428  outer membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1287  outer membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3471  outer membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.31165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3509  outer membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3277  outer membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  45.77 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  45.77 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  45.77 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  45.77 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  45.77 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  41.67 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  41.67 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000817006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0037  17 kDa surface antigen  50.97 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0915  17 kDa surface antigen  47.06 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.852143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  41.67 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0208  surface antigen protein  51.3 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  43.05 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  43.05 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  43.05 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  43.05 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  43.05 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  43.05 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  43.05 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  43.05 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  43.05 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3037  17 kDa surface antigen  41.67 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1807  17 kDa surface antigen  43.8 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55882  hitchhiker  0.000926812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2627  17 kDa surface antigen  41.03 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.940371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2785  17 kDa surface antigen  43.31 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  42.45 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0170  outer membrane lipoprotein, putative  60.29 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0832777 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2665  17 kDa surface antigen  47.97 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2381  17 kDa surface antigen  47.97 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00375113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003797  putative outer membrane lipoprotein Pcp  41.61 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  31.88 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3070  17 kDa surface antigen  39.42 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1690  17 kDa surface antigen  44.59 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0804  17 kDa surface antigen  41.48 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  31.85 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0378  outer membrane lipoprotein PcP  43.07 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1219  outer membrane lipoprotein PcP  43.07 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  29.94 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  31.85 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  29.3 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1723  17 kDa surface antigen  43.71 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00134301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0445  17 kDa surface antigen  41.1 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2965  17 kDa surface antigen  42.21 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.879461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  32.28 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  30.53 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  28.66 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1310  17 kDa surface antigen  35.67 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13567 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  34.97 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  29.38 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4999  hypothetical protein  35.34 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1150  Outer membrane lipoprotein-like  41.26 
 
 		 303 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527599  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2250  17 kDa surface antigen  31.78 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454882  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2223  17 kDa surface antigen  30.57 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000654513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1570  17 kDa surface antigen  32.5 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000417711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  36.07 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0736  17 kDa surface antigen  41.67 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1883  17 kDa surface antigen  32.28 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119533  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2461  17 kDa surface antigen  32.28 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000826442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0665  outer membrane lipoprotein PcP  40.38 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2581  17 kDa surface antigen  32.28 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000185697  normal  0.0842318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0952  outer membrane lipoprotein pcp precursor  42.57 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.013543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  33.88 
 
 		 250 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1733  outer membrane lipoprotein, putative  34.3 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00359299  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  36.59 
 
 		 247 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01571  hypothetical protein  30.23 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  31.71 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  31.71 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6520  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  27.92 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>