88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2622 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  95.51 
 
 		 156 aa  306  5e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  94.87 
 
 		 156 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  96.6 
 
 		 147 aa  289  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  85.9 
 
 		 156 aa  279  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2223  17 kDa surface antigen  86.54 
 
 		 156 aa  266  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000654513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2461  17 kDa surface antigen  86.54 
 
 		 156 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000826442  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2581  17 kDa surface antigen  86.54 
 
 		 156 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000185697  normal  0.0842318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1883  17 kDa surface antigen  86.54 
 
 		 156 aa  263  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119533  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  72.15 
 
 		 158 aa  241  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  73.42 
 
 		 160 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  68.35 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  60.9 
 
 		 155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  70.68 
 
 		 164 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2250  17 kDa surface antigen  68.83 
 
 		 164 aa  192  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454882  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1570  17 kDa surface antigen  68.9 
 
 		 163 aa  189  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000417711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0595  hypothetical protein  58.39 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003952  outer membrane lipoprotein  44.22 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0034992  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01571  hypothetical protein  44.16 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  36.59 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  45.83 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  44.44 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  45.68 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  46.05 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  45 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  46.05 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  36.43 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4325  hypothetical protein  30.43 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  38.04 
 
 		 217 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  43.37 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  43.37 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  43.37 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  43.37 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  43.37 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  40.48 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  43.37 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50740  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688218 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  40.48 
 
 		 215 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  40.48 
 
 		 215 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  43.37 
 
 		 218 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  36.44 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  36.44 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  36.44 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  34.33 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  36.44 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  36.44 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  40.48 
 
 		 206 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  42.17 
 
 		 208 aa  44.3  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  40.48 
 
 		 204 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3852  lipoprotein SlyB, putative  31.3 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  35.16 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  40.48 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4999  hypothetical protein  32.97 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  32.32 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  35.59 
 
 		 155 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  35.59 
 
 		 155 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  35.59 
 
 		 155 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  35.59 
 
 		 155 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  35.59 
 
 		 155 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  35.59 
 
 		 155 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  35.59 
 
 		 155 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  35.59 
 
 		 155 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  35.59 
 
 		 155 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  34.07 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  38.27 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  33.88 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1131  17 kDa surface antigen  33.85 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4284  17 kDa surface antigen  33.85 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19520  outer membrane lipoprotein  25.86 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>