16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1612 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1612  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 127 aa  246  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5253  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 127 aa  246  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438086  normal  0.967685 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6233  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  57.14 
 
 		 157 aa  141  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0997303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6520  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  51.59 
 
 		 153 aa  103  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5596  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  48.41 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.04 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3037  17 kDa surface antigen  38.36 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2627  17 kDa surface antigen  38.36 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.940371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  34.21 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  34.65 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  34.65 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  34.65 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  34.65 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  34.65 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  37.66 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 155 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>