98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2250 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2250  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 164 aa  331  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454882  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  63.41 
 
 		 164 aa  220  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  67.92 
 
 		 158 aa  217  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  66.67 
 
 		 160 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  68.83 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  68.18 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  67.53 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  71.72 
 
 		 147 aa  206  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  64.33 
 
 		 158 aa  202  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  62.96 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  66.89 
 
 		 155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2223  17 kDa surface antigen  67.28 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000654513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1570  17 kDa surface antigen  64.29 
 
 		 163 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000417711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1883  17 kDa surface antigen  64.81 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119533  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2461  17 kDa surface antigen  64.81 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000826442  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2581  17 kDa surface antigen  64.81 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000185697  normal  0.0842318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003952  outer membrane lipoprotein  49.02 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0034992  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01571  hypothetical protein  43.31 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0595  hypothetical protein  53.24 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  36.99 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  44.44 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  44.44 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  44.44 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  33.96 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  29.73 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  32.24 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6233  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  28.1 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0997303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  34.48 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  41.67 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  31.68 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  36.92 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4325  hypothetical protein  30.92 
 
 		 154 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50740  hypothetical protein  30.92 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688218 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4284  17 kDa surface antigen  32.89 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  38.27 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  36.44 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  36.44 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  36.44 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  36.44 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  36.44 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1131  17 kDa surface antigen  32.89 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  42.5 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  42.5 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  42.5 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  42.5 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  42.5 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  42.5 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1231  surface antigen protein  33.54 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  42.5 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  58.97 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  58.97 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  41.25 
 
 		 208 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  58.97 
 
 		 216 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  58.97 
 
 		 216 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  36.67 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  36.67 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  36.67 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  37.5 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  38.33 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1167  17 kDa surface antigen  32.24 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  37.5 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  37.5 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  37.5 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  37.5 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  58.97 
 
 		 206 aa  43.9  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  58.97 
 
 		 204 aa  43.9  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  36.67 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003797  putative outer membrane lipoprotein Pcp  35.56 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3852  lipoprotein SlyB, putative  33.85 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  61.54 
 
 		 272 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1807  17 kDa surface antigen  34.62 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55882  hitchhiker  0.000926812 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4999  hypothetical protein  34.44 
 
 		 168 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  33.33 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000817006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  33.33 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  38.6 
 
 		 177 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  54.29 
 
 		 257 aa  41.2  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  54.29 
 
 		 257 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3037  17 kDa surface antigen  28.57 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>