More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6202 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  85.79 
 
 		 401 aa  635    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  93.77 
 
 		 401 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  100 
 
 		 401 aa  785    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  87.05 
 
 		 390 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  88.83 
 
 		 390 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  86.16 
 
 		 390 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  78.16 
 
 		 397 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  81.72 
 
 		 390 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  81.46 
 
 		 390 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  81.72 
 
 		 390 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  77.92 
 
 		 392 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  77.66 
 
 		 392 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  75.32 
 
 		 394 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  75.06 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  75 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  75 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  74.74 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  69.19 
 
 		 385 aa  503  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  70.68 
 
 		 398 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  72.56 
 
 		 400 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  63.87 
 
 		 393 aa  482  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  69.67 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  65.07 
 
 		 382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  59.5 
 
 		 395 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  59.02 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  76.11 
 
 		 188 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  76.11 
 
 		 188 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  76.88 
 
 		 187 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  76.88 
 
 		 187 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.05 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  37.04 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.51 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  35.13 
 
 		 382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  29.95 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  31.81 
 
 		 389 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.58 
 
 		 391 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.74 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.03 
 
 		 387 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.58 
 
 		 404 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  32.81 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  34.05 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.51 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  30.4 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  29.38 
 
 		 376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  29.25 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  33.44 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  27.62 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  27.52 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.21 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  29.1 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.89 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  28.8 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.58 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  28.68 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  27.71 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  28.16 
 
 		 450 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  29.75 
 
 		 376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  29.81 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  28.9 
 
 		 456 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  30.4 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  27.09 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  30.82 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  28.17 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  27.18 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  29.32 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  29.55 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.79 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.01 
 
 		 467 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.06 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  27.23 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  28.19 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  25 
 
 		 416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  31.48 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.18 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.79 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  27.82 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  26.83 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.91 
 
 		 441 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  26.54 
 
 		 444 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  25.06 
 
 		 456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  25.07 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  25.07 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.88 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  26.18 
 
 		 443 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  25.59 
 
 		 461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1609  chromate transporter  34.09 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  25.98 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  26.97 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  25.85 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  29.48 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.09 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.67 
 
 		 465 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.05 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.09 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  26.69 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  35.77 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.03 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.03 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  26.5 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  27.11 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>