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for query gene Sfum_0092 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  100 
 
 
428 aa  843    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  59.25 
 
 
388 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  33.94 
 
 
453 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  33.5 
 
 
456 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  32.44 
 
 
456 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.3 
 
 
441 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  32.99 
 
 
450 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.03 
 
 
404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.51 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  35.48 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.4 
 
 
386 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  31.91 
 
 
382 aa  162  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  32.57 
 
 
389 aa  162  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  33.25 
 
 
483 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  33.93 
 
 
447 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  32.41 
 
 
379 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.8 
 
 
379 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.03 
 
 
469 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  32.72 
 
 
442 aa  156  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  29.4 
 
 
385 aa  156  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  31.96 
 
 
383 aa  156  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  29.34 
 
 
393 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.71 
 
 
387 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  34.26 
 
 
428 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.51 
 
 
457 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.37 
 
 
394 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  32 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.52 
 
 
387 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.77 
 
 
467 aa  152  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  32.38 
 
 
454 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  34.17 
 
 
450 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  31.35 
 
 
376 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.15 
 
 
397 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  34.24 
 
 
432 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  33.25 
 
 
467 aa  149  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  30.34 
 
 
376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  29.72 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.31 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.77 
 
 
396 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.45 
 
 
392 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.77 
 
 
396 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.77 
 
 
396 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.17 
 
 
471 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  36.39 
 
 
417 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  32.14 
 
 
461 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.09 
 
 
393 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  30.18 
 
 
393 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.11 
 
 
391 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  34.22 
 
 
460 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  32.02 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.77 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.38 
 
 
465 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  29.77 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  29.89 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.91 
 
 
382 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  31.2 
 
 
443 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  29.26 
 
 
392 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.23 
 
 
390 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  32.49 
 
 
469 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.19 
 
 
472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.61 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.28 
 
 
469 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.11 
 
 
472 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  28.1 
 
 
390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  28.49 
 
 
398 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  28.65 
 
 
401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  28.95 
 
 
376 aa  133  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.44 
 
 
473 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  28.43 
 
 
399 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.64 
 
 
400 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  27.89 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  26.63 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  25.64 
 
 
408 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  28.17 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  26.06 
 
 
412 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  36.3 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  30.46 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  30.46 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.1 
 
 
473 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  31.34 
 
 
466 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.89 
 
 
416 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  25.07 
 
 
408 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  33.16 
 
 
456 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  27.11 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  27.11 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  28.4 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  40.48 
 
 
450 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.2 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2656  chromate transporter  34.88 
 
 
507 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  26.9 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  41.18 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  31.27 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
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NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  41.33 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
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NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.77 
 
 
450 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
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NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  39.24 
 
 
455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
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NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  41.83 
 
 
418 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
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NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  38.04 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.755683 
 
 
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NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  42.42 
 
 
446 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  30.09 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
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NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.9 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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